涩谷站前广场发生了多人受伤的爆炸事件警部补志村贵文（高桥一生饰）在等待支援时，街头播放着神秘男子的新爆炸预告影像，他要求用志村交换下一次爆炸的情报。志村去了指定的地方，等待他的

主人公藤木圭介是一位医术卓越的天才脑外科医生，某日恋人八神妙子从医院的楼顶上坠落，而他却被指控为将女友从医院屋顶推落意图杀害的犯罪嫌疑人为了找出案件的真相，他放弃了地位与名誉，

かわぐちかいじの同名マンガを映画化した「沈黙の艦隊」の続編にあたる物語が後半で紡がれる