国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠 配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何

160年，掌握了恒星飞行技术的人类开始了星际移民，行星改造技术也随之兴起CRUSHER其实就是宇宙便利屋，接受各种各样的委托，主角JOE在度假的时候接受了来自基利斯的营救囚犯的

　　在实验室里工作的涅被像镰刀一样的东西袭击，身体产生了异变　　涅突然像疯了似的，没有缘由地乱敲试验装置的操作盘。　　於是，一瞬间瀞灵廷被灵子云所覆盖，死神们都准备去联络涅。　

宇宙世紀(U.C.)0093年，成為新吉恩總帥的夏亚·阿兹纳布尔對於依然被地球重力所束縛的人類靈魂感到絕望，決心以激烈的手段加以肅正查知此事的地球聯邦軍王牌駕駛阿姆罗·雷與其所

橘发少年黑崎一护是个正义感爆棚的高中生，与父亲、两个妹妹共同生活，从小他就有能看见鬼魂的本事，但并不以为意一天夜里一只叫“虚”的怪物攻击了一护和他的家人，尾随怪物而来的死神朽木